Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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GEN1Q17RS7 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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GEN1Q17RS7 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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GEN1Q17RS7 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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GEN1Q17RS7 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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GEN1Q17RS7 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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