Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CDO1Q16878 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CDO1Q16878 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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