Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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SGCAQ16586 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SGCAQ16586 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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SGCAQ16586 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
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SGCAQ16586 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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SGCAQ16586 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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SGCAQ16586 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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SGCAQ16586 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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SGCAQ16586 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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SGCAQ16586 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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SGCAQ16586 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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