Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
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SYCP1Q15431 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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SYCP1Q15431 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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SYCP1Q15431 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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SYCP1Q15431 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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SYCP1Q15431 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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SYCP1Q15431 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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SYCP1Q15431 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SYCP1Q15431 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SYCP1Q15431 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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