Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 AC009118.3-201ENST00000622896 873 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms