Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSPNQ14714 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms