Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms