Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEUROD1Q13562 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
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