Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CDK5R2Q13319 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms