Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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