Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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SRSF6Q13247 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SRSF6Q13247 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SRSF6Q13247 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
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