Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

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Length 653 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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TRIM32Q13049 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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TRIM32Q13049 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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TRIM32Q13049 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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TRIM32Q13049 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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TRIM32Q13049 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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TRIM32Q13049 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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TRIM32Q13049 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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TRIM32Q13049 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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TRIM32Q13049 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM32Q13049 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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