Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNMA1Q12791 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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KCNMA1Q12791 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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KCNMA1Q12791 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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KCNMA1Q12791 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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