Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDE4DQ08499 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms