Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK18Q07002 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK18Q07002 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms