Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms