Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 EGFR-AS1-201ENST00000442411 2806 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 PAK3-211ENST00000518291 2098 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 CACNG3-201ENST00000005284 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GABPB1Q06547 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms