Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms