Protein–RNA interactions for Protein: Q04864

REL, Proto-oncogene c-Rel, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELQ04864 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RELQ04864 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RELQ04864 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RELQ04864 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RELQ04864 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RELQ04864 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RELQ04864 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RELQ04864 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RELQ04864 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RELQ04864 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RELQ04864 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RELQ04864 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RELQ04864 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RELQ04864 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RELQ04864 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RELQ04864 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RELQ04864 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RELQ04864 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RELQ04864 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RELQ04864 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RELQ04864 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RELQ04864 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RELQ04864 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RELQ04864 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RELQ04864 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RELQ04864 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RELQ04864 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RELQ04864 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RELQ04864 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RELQ04864 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RELQ04864 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RELQ04864 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RELQ04864 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RELQ04864 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RELQ04864 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RELQ04864 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RELQ04864 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RELQ04864 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RELQ04864 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RELQ04864 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms