Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1DQ01668 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms