Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TFAMQ00059 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TFAMQ00059 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms