Protein–RNA interactions for Protein: P84085

ARF5, ADP-ribosylation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF5P84085 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF5P84085 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF5P84085 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ARF5P84085 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ARF5P84085 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ARF5P84085 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms