Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD3P84022 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms