Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRX1P78414 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRX1P78414 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRX1P78414 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRX1P78414 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRX1P78414 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRX1P78414 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRX1P78414 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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IRX1P78414 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRX1P78414 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRX1P78414 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRX1P78414 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRX1P78414 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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IRX1P78414 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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IRX1P78414 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRX1P78414 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRX1P78414 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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IRX1P78414 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRX1P78414 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRX1P78414 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRX1P78414 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRX1P78414 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRX1P78414 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRX1P78414 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRX1P78414 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRX1P78414 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRX1P78414 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRX1P78414 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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IRX1P78414 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRX1P78414 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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IRX1P78414 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRX1P78414 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRX1P78414 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRX1P78414 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
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IRX1P78414 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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IRX1P78414 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRX1P78414 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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IRX1P78414 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
IRX1P78414 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IRX1P78414 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IRX1P78414 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IRX1P78414 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15□□□□□ -0.01
IRX1P78414 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
IRX1P78414 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRX1P78414 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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IRX1P78414 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRX1P78414 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IRX1P78414 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRX1P78414 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRX1P78414 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRX1P78414 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRX1P78414 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRX1P78414 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRX1P78414 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
IRX1P78414 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRX1P78414 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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