Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms