Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
RPS29P62273 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
RPS29P62273 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms