Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PGGT1BP53609 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGGT1BP53609 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PGGT1BP53609 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGGT1BP53609 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PGGT1BP53609 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGGT1BP53609 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PGGT1BP53609 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PGGT1BP53609 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PGGT1BP53609 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGGT1BP53609 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGGT1BP53609 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGGT1BP53609 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGGT1BP53609 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PGGT1BP53609 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGGT1BP53609 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PGGT1BP53609 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PGGT1BP53609 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PGGT1BP53609 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PGGT1BP53609 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PGGT1BP53609 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PGGT1BP53609 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PGGT1BP53609 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PGGT1BP53609 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PGGT1BP53609 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PGGT1BP53609 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PGGT1BP53609 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PGGT1BP53609 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGGT1BP53609 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGGT1BP53609 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGGT1BP53609 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGGT1BP53609 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGGT1BP53609 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGGT1BP53609 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PGGT1BP53609 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGGT1BP53609 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGGT1BP53609 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGGT1BP53609 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PGGT1BP53609 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGGT1BP53609 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PGGT1BP53609 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PGGT1BP53609 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PGGT1BP53609 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PGGT1BP53609 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PGGT1BP53609 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PGGT1BP53609 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PGGT1BP53609 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PGGT1BP53609 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PGGT1BP53609 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PGGT1BP53609 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PGGT1BP53609 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PGGT1BP53609 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PGGT1BP53609 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PGGT1BP53609 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PGGT1BP53609 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PGGT1BP53609 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
PGGT1BP53609 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PGGT1BP53609 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PGGT1BP53609 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PGGT1BP53609 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PGGT1BP53609 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PGGT1BP53609 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PGGT1BP53609 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PGGT1BP53609 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PGGT1BP53609 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PGGT1BP53609 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PGGT1BP53609 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms