Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2A2P52657 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms