Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMARCA2P51531 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA2P51531 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms