Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CRIP1P50238 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms