Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTPAP49638 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTPAP49638 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTPAP49638 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTPAP49638 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTPAP49638 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTPAP49638 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
TTPAP49638 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTPAP49638 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTPAP49638 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTPAP49638 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTPAP49638 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTPAP49638 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTPAP49638 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TTPAP49638 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTPAP49638 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTPAP49638 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TTPAP49638 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TTPAP49638 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTPAP49638 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TTPAP49638 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
TTPAP49638 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TTPAP49638 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTPAP49638 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TTPAP49638 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TTPAP49638 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TTPAP49638 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTPAP49638 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TTPAP49638 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTPAP49638 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTPAP49638 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTPAP49638 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTPAP49638 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TTPAP49638 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TTPAP49638 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TTPAP49638 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TTPAP49638 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TTPAP49638 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TTPAP49638 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TTPAP49638 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TTPAP49638 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TTPAP49638 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TTPAP49638 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TTPAP49638 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TTPAP49638 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TTPAP49638 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TTPAP49638 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TTPAP49638 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TTPAP49638 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TTPAP49638 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTPAP49638 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTPAP49638 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTPAP49638 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTPAP49638 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTPAP49638 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTPAP49638 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTPAP49638 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTPAP49638 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTPAP49638 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTPAP49638 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTPAP49638 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTPAP49638 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTPAP49638 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TTPAP49638 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTPAP49638 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTPAP49638 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TTPAP49638 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTPAP49638 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTPAP49638 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TTPAP49638 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTPAP49638 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTPAP49638 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTPAP49638 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTPAP49638 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTPAP49638 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTPAP49638 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTPAP49638 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTPAP49638 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TTPAP49638 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TTPAP49638 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms