Protein–RNA interactions for Protein: P49116

NR2C2, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C2P49116 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR2C2P49116 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms