Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIP4K2AP48426 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms