Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRCC3P46736 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms