Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD13P35453 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD13P35453 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms