Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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HOXD12P35452 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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HOXD12P35452 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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HOXD12P35452 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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HOXD12P35452 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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