Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms