Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PSMB5P28074 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms