Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms