Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTNNA2P26232 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.1 ms