Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA3P25788 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMA3P25788 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMA3P25788 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMA3P25788 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMA3P25788 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMA3P25788 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMA3P25788 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMA3P25788 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMA3P25788 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMA3P25788 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMA3P25788 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PSMA3P25788 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMA3P25788 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMA3P25788 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PSMA3P25788 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA3P25788 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA3P25788 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA3P25788 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA3P25788 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA3P25788 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA3P25788 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA3P25788 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA3P25788 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA3P25788 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA3P25788 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA3P25788 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA3P25788 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PSMA3P25788 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA3P25788 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA3P25788 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PSMA3P25788 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PSMA3P25788 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA3P25788 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA3P25788 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA3P25788 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA3P25788 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA3P25788 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA3P25788 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA3P25788 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA3P25788 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA3P25788 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA3P25788 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA3P25788 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA3P25788 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA3P25788 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA3P25788 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA3P25788 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PSMA3P25788 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA3P25788 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PSMA3P25788 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA3P25788 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA3P25788 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA3P25788 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA3P25788 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA3P25788 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA3P25788 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA3P25788 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA3P25788 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA3P25788 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA3P25788 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA3P25788 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA3P25788 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA3P25788 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA3P25788 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA3P25788 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA3P25788 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA3P25788 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA3P25788 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA3P25788 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PSMA3P25788 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA3P25788 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA3P25788 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA3P25788 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA3P25788 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA3P25788 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA3P25788 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA3P25788 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA3P25788 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PSMA3P25788 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA3P25788 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PSMA3P25788 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA3P25788 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA3P25788 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PSMA3P25788 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PSMA3P25788 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA3P25788 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA3P25788 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA3P25788 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA3P25788 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA3P25788 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA3P25788 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA3P25788 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA3P25788 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA3P25788 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA3P25788 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA3P25788 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMA3P25788 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.1 ms