Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRKCHP24723 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCHP24723 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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