Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS6KB1P23443 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS6KB1P23443 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms