Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGS1P23219 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTGS1P23219 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms