Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRHP20396 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRHP20396 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRHP20396 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRHP20396 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRHP20396 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRHP20396 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRHP20396 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRHP20396 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRHP20396 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRHP20396 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRHP20396 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRHP20396 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRHP20396 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRHP20396 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRHP20396 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRHP20396 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRHP20396 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRHP20396 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRHP20396 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRHP20396 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRHP20396 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRHP20396 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRHP20396 AC000078.1-201ENST00000420617 682 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRHP20396 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRHP20396 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRHP20396 IQSEC2-205ENST00000498281 673 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRHP20396 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRHP20396 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRHP20396 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRHP20396 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRHP20396 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRHP20396 GABARAPL1-219ENST00000629504 379 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRHP20396 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRHP20396 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRHP20396 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRHP20396 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRHP20396 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRHP20396 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRHP20396 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRHP20396 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRHP20396 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRHP20396 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRHP20396 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRHP20396 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRHP20396 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRHP20396 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRHP20396 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRHP20396 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRHP20396 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRHP20396 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRHP20396 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRHP20396 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRHP20396 AC117834.1-201ENST00000523197 602 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRHP20396 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRHP20396 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRHP20396 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRHP20396 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRHP20396 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRHP20396 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRHP20396 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRHP20396 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRHP20396 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRHP20396 AC022167.5-201ENST00000636296 1250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRHP20396 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRHP20396 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRHP20396 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRHP20396 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRHP20396 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRHP20396 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRHP20396 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRHP20396 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRHP20396 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRHP20396 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRHP20396 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRHP20396 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRHP20396 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRHP20396 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRHP20396 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRHP20396 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRHP20396 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRHP20396 AC011997.1-201ENST00000409845 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRHP20396 AC079325.1-201ENST00000430386 857 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRHP20396 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRHP20396 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRHP20396 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRHP20396 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRHP20396 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRHP20396 AC099343.1-201ENST00000513481 609 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRHP20396 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRHP20396 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRHP20396 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRHP20396 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRHP20396 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRHP20396 BCAS4-206ENST00000609336 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRHP20396 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRHP20396 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRHP20396 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRHP20396 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRHP20396 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms