Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNNI3P19429 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms