Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCP1P17987 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCP1P17987 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TCP1P17987 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TCP1P17987 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCP1P17987 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCP1P17987 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCP1P17987 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCP1P17987 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCP1P17987 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCP1P17987 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TCP1P17987 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TCP1P17987 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCP1P17987 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCP1P17987 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCP1P17987 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCP1P17987 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCP1P17987 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCP1P17987 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCP1P17987 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCP1P17987 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCP1P17987 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCP1P17987 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCP1P17987 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCP1P17987 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCP1P17987 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TCP1P17987 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TCP1P17987 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TCP1P17987 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TCP1P17987 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCP1P17987 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCP1P17987 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCP1P17987 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCP1P17987 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCP1P17987 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TCP1P17987 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TCP1P17987 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TCP1P17987 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TCP1P17987 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCP1P17987 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCP1P17987 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCP1P17987 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCP1P17987 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCP1P17987 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCP1P17987 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCP1P17987 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCP1P17987 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCP1P17987 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCP1P17987 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCP1P17987 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCP1P17987 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCP1P17987 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCP1P17987 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TCP1P17987 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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