Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCP1P13796 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCP1P13796 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCP1P13796 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCP1P13796 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCP1P13796 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCP1P13796 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCP1P13796 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCP1P13796 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCP1P13796 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCP1P13796 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCP1P13796 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LCP1P13796 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LCP1P13796 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCP1P13796 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LCP1P13796 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCP1P13796 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCP1P13796 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCP1P13796 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCP1P13796 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCP1P13796 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCP1P13796 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCP1P13796 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCP1P13796 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCP1P13796 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCP1P13796 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCP1P13796 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCP1P13796 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCP1P13796 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCP1P13796 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCP1P13796 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCP1P13796 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCP1P13796 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCP1P13796 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LCP1P13796 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCP1P13796 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCP1P13796 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCP1P13796 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LCP1P13796 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LCP1P13796 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCP1P13796 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCP1P13796 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LCP1P13796 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCP1P13796 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LCP1P13796 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LCP1P13796 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCP1P13796 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCP1P13796 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCP1P13796 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCP1P13796 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCP1P13796 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCP1P13796 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCP1P13796 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCP1P13796 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCP1P13796 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCP1P13796 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCP1P13796 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCP1P13796 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCP1P13796 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCP1P13796 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LCP1P13796 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCP1P13796 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCP1P13796 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCP1P13796 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCP1P13796 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCP1P13796 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCP1P13796 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCP1P13796 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCP1P13796 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCP1P13796 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCP1P13796 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCP1P13796 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCP1P13796 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCP1P13796 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCP1P13796 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCP1P13796 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCP1P13796 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LCP1P13796 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCP1P13796 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCP1P13796 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCP1P13796 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LCP1P13796 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCP1P13796 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCP1P13796 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCP1P13796 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCP1P13796 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCP1P13796 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCP1P13796 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCP1P13796 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCP1P13796 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCP1P13796 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCP1P13796 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCP1P13796 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCP1P13796 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCP1P13796 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCP1P13796 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCP1P13796 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCP1P13796 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCP1P13796 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LCP1P13796 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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