Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOP08100 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOP08100 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOP08100 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOP08100 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOP08100 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOP08100 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOP08100 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOP08100 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOP08100 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOP08100 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOP08100 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOP08100 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOP08100 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOP08100 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOP08100 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOP08100 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOP08100 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOP08100 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOP08100 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOP08100 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOP08100 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOP08100 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOP08100 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOP08100 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOP08100 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOP08100 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOP08100 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOP08100 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOP08100 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOP08100 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOP08100 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOP08100 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOP08100 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOP08100 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOP08100 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHOP08100 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHOP08100 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHOP08100 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHOP08100 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHOP08100 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHOP08100 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHOP08100 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHOP08100 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHOP08100 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHOP08100 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHOP08100 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHOP08100 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHOP08100 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOP08100 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms