Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAVP06756 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ITGAVP06756 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ITGAVP06756 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ITGAVP06756 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ITGAVP06756 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ITGAVP06756 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ITGAVP06756 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAVP06756 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAVP06756 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAVP06756 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAVP06756 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAVP06756 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAVP06756 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAVP06756 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAVP06756 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAVP06756 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAVP06756 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAVP06756 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAVP06756 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAVP06756 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAVP06756 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAVP06756 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAVP06756 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAVP06756 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAVP06756 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAVP06756 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAVP06756 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAVP06756 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAVP06756 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAVP06756 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms